作为经典的横版过关射击游戏，魂斗罗为人称道的就是丰富的武器系统。霰弹枪，镭射或者来福枪，都在不同的地形与关卡发挥着重要的作用。强大的武器自然会让玩家在闯关时无往不利。此次《魂斗罗：归来》的武器系统沿用了腾讯手游的碎片模式，玩家可以在官方商城挑选自己心仪的枪支，而且通过完成任务，收集拼图，特殊活动也能得到稀有的利器。

在魂斗罗归来中，武器的获取方式主要有两种，一种是直接获取，另一种是碎片合成。但是在游戏中，绝大数的武器都是无法直接获取的，往往都是通过碎片合成来获取。因此武器的获取途径其实就是武器碎片的获取途径。

一、商城购买

在游戏中，通过商城购买是获取武器最直接的的途径。游戏商城包含了幸运射击，极品武器，道具商店和模式商店等等，这些商城全部都有武器出售，需要花费不同的代币来进行购买。而在游戏商城中，不仅有武器碎片，还有着整把的武器出售，可以让玩家快速的获取到自己心仪的武器。

二、组队模式

组队闯关一直是魂斗罗的精髓所在，而魂斗罗归来为了鼓舞玩家积极的参与组队冒险模式，在组队冒险模式的奖励下就设置了多种武器的碎片。玩家成功的通关组队模式的关卡，就有机会获取到相应武器的碎片。不过在组队模式下，每个关卡获取到的武器的碎片种类是固定的，因此想要获取自己想要武器的碎片，就得找到相应的关卡才行。