开发商Game Freak与任天堂的合作关系甚至早在《口袋妖怪》系列游戏面世之前就已经确立了。《口袋妖怪》无疑是开发商最骄傲的作品，尽管他们开始脱离任天堂做一些别的游戏例如《坏象坦博》（任天堂平台游戏）、《千兆破坏者》（PC独占）。不过，《口袋妖怪》游戏不太可能离开任天堂的平台。

Game Freak的联合创始人増田順一与外媒杂志Game Informer进行了对话，讨论了到底谁拥有“口袋妖怪”的问题。问题提的非常刁钻，増田順一表示版权归属于三个公司：任天堂、Game Freak和Creatures公司。

另一个问题是《口袋妖怪》系列未来有没有可能在任天堂之外的其他平台发售（不包括移动平台的周边游戏，这些游戏都不是Game Freak做的）他的回答是：

“对于《口袋妖怪》，我们认为他对任天堂非常重要，所以我觉得这是不可能发生的。”

Game Freak与任天堂合作的新《口袋妖怪》游戏是11月份即将发售的《口袋妖怪:究极日月》，系列的Switch移植版目前也正在开发中。