《质量效应：仙女座》发售以后引来了许多争议，有人诟病游戏中经常出现的bug，有人诟病僵硬的人物表情，也有人表示游戏内的文字字体有问题，很多时候字号都还小，视力不好的玩家很难看清字幕。

BioWare发言人Ian S. Fraizer表示，虽然这个问题无法马上得到解决，但已经有足够多的玩家反映了这一问题，所以开发团队一定会着手开始解决。

另外，游戏中的百科codex也存在一个问题，有些词条的内容会对游戏剧情造成剧透。这个问题将在下一个更新档中修复。