游戏一开始NEO在一个虚拟的空间里，这里会不断出现敌人。其实这个就是个各位玩家熟悉一下操作，打到你挂了以后游戏才正式开始。(注意:这时候电脑会根据玩家的表现来评估适合玩家的游戏难度)

第1关

　　和电影一样，第一关讲述的是特工来抓NEO的剧情，本关是类似与MGS的潜入类型关卡不需要杀敌，根据游戏中给的提示(画面上会有闪光的地方)走，来到一个办公室，开窗子来到外面做升降机上楼，当升降机停下后走出来会发生一段小剧情，剧情后出现一个警察，把他推下楼，继续沿着墙边走，小心不要掉下去了，继续做升降机来到楼顶，出现很多警察，把他们推倒，然后快速进门，这里大家要注意一下，一旦本警察抓主，马上按键挣脱，点慢了马上就GAMEOVER，进门后顺着楼梯一直向下走，来到一个房间，这里有3个警察，小心不要被抓到，从房间右边的紧急出口向下跑，有来到NEO的办公室，继续跟着提示跑到终点本关结素。

PS。本关的设计比较人性化，对于某写对潜入类型苦手的玩家在被抓一次后可以直接挑过此关。

　　
第2关

　　从本关以后的好几关都是叙述NEO怎样学习武功，虽然电影里NEO只是翻了几下白眼就说(I KNOW GONGFU)但是游戏中制作者把NEO学习功夫的剧情做为关卡详细的呈现给大家。本关开始NEO打扮成DOA里"李剑"华丽登场，而且连打人的动作都差不多，根据游戏的教学提示一直杀过去，中间没有分支，一直杀到头就是BOSS战。

　　BOSS战:很简单，回避到后面，发动FORCE，3招就能解决，但是要注意不要给他抓到，解决他以后本关结素。

　　PS:从本关以后，没关开始前都会让大家选择FORCE，在选择的时候可以按X键查看这个FORCE的功能和发动方法，并配有动画显示

　　
第3关

　　
　　本关是教导玩家怎样使用格斗武器，一开始玩家手上就有把日本刀，并且会得到新的FORCE，，根据教学提示把本关的敌人杀完OK了，

第4关

　　 一上来就是BOSS战，BOSS是个日本武士，耍刀很厉害，多注意用刚刚学到的FORCE，打一会催尼缔会来帮忙，BOSS会用影分身之术，不过分身都不厉害，两人合作能轻松搞定。接着进入下半部分，一开始是在一个庭院里，冲过去砍死几个敌人，进入房间，房间里有BOSS，但是现在还杀不了他，跟着他走，路上他会放火墙，发动FORCE后在按X能跳过去，一路上有杂兵骚扰，全部灭之，杀到最里面的房间就是BOSS战，这个BOSS是个BC，没有特定打法，喜欢怎样虐待他，请大家自便吧。

第5关

　　相当恶搞的一关，场景是在一个中国的小酒馆里，任务为在限定时间里得到尽可能搞的分数。接着EG开始，从门外冲进一堆斧头帮帮众(样子和某电影里的一样)而且还打叫，"我要宰了你"(绝对中文发音)拿起旁边的斧子上去和他们对砍，坚持到时间结素即可过关。要注意的是后面会出现扔飞斧的敌人要小心

　　
第6关

　　本关同样是教学关，不过只能使用射击武器，场景一样是中国，BOSS也是一开始出现，但是杀不了，跟着他整栋楼跑几次，最后来到顶楼才能杀他，本关的敌人同样全部持枪，而且火力很猛，多使用FORCE来躲子弹，打BOSS时先把旁边的杂兵杀完，如果你的HP还有1半以上，就去和BOSS硬拼吧。

　　
第7关

　　终于来到电影中最精彩剧情之一 摩非斯 VS NEO， 摩非斯的攻击强，被他连到一套可不是开玩笑的，使用战术能很快解决他，打死他一次后，会他又会加满血和你打一次，并且给你新的FORCE。再次打败他后，进入下半部分，你必须比他先到达电话所在地，路上要跳好几个坑，还要爬抢，使用FORCE+跳能轻松过去，难点在最后一面墙那里，这面墙很高，所以FORCE的2段条也上不去，必须要先贴着右边或者左边跑，先跳到正面墙上，然后再跳到旁边的墙上如此反复3次即可。

　　
第8关

　　
　　到了本关游戏才真正开始，摩非斯带NEO去见先知，回来的路上被围捕，一开始NEO就和大家分开了，得到新的FORCE能打坏有裂缝的墙，本关象个迷宫一样，大家要多注意墙壁，看到裂缝就打破才能有新的通路，路上的敌人全是持枪警察，想怎么打随便玩家选择，个人推荐肉搏。

　　一直来到顶楼发生剧情摩非斯为了让众人撤退对子面对特工，NEO带着大家逃跑，路上出来的警察全部打倒会出现C4炸弹，根据催尼缔的提示把炸弹安放好，并且爆破。当来到第2根柱子的时候刚刚放好炸弹，NEO又被强行和大家分开，这是千万不要引爆炸弹，不然自己上西天，等同伴说完话后发生剧情，之后会出现一个特工，他是打不死的，就算把他打到台下也不会死，尽量和他周旋，过一会同伴会炸开墙，然后马上用FORCE跳过去，剧情后顺路走，消灭路上的敌人到达出口本关结素。

第9关

　　又是经典剧情之一，尼欧和催尼缔前去就摩非斯，一开始在大堂里出现成批敌人，不过全都是小白，各位在这里可以随意耍COOL，一共会增援3批敌人，第3批增援是4个小BOSS，不过都很菜。把敌人全灭后就可以进入下半部分，下半部分是在楼顶打，特工会出现好几次，而且普通攻击对他无效，要杀死他只能把他打到高压电上，或者打到楼下，而且敌人还会不段增援再加上有时间限制，可以说是很有难度的一关，在杀完一定数目的敌人后发生剧情，出现30秒倒计时，这时不要管旁边的敌人，直接往直升机方向跑，跑到大楼边缘的时候马上发动FORCE二段跳跳上飞机。

　　之后是最难的地方，在飞机上用机枪消灭房顶的敌人，打一会后会出现敌人的飞机，这时摩非斯的HP开始报警，注意这时候会有特工出现，要打死特工必须用FORCE射击，还有就是千万不要扫射，不然连老摩一起KO了，在老摩逃跑的时候旁边还会出现一个特工，大家注意一下，)把飞机打掉，在把楼房里的敌人杀完救出出老摩后出现剧情。剧情后就是NEO对SMITH，注意他是打不死的，会无限恢复HP，必须要象原作里那样把他打到地铁跑道上让地铁轧死他才行，之后就是逃跑，顺路一直往下走，走到指定地点本关结束。

　　
第10关

　　本关开始在一个奇怪的地铁站，往前走地铁会来，但是需要车票，返回楼梯上会看到空中飘着好多闪光的东西，在那里按L2能拿到车票，上车后一直向车后面走，到第3节车厢时注意不要掉下去，来到第4节车厢看到电话，这时要发动FORCE才能走过去，通过电话得知要找到真确的门才能离开，回到第2节车厢，在墙上有个开关，按下去就能停车，这时候需要调整一下，首先反复进入这个车厢，直到车厢是正的为止，然后听到列车员说话马上按下开关就能找到正确的门，出来后又是一个地铁站，SIMITH和大群杂兵出现，这时不要只想着打，看到火车过来马上跳上去逃跑，因为杂兵是打不完的。下火车后上楼梯，之后又是大逃亡，千万不要打，顺路跑，只有1条路所以不用当心迷路，跑到303房间后发生剧情，NEO力量觉醒，然后开始虐待3个特工，虐待完后本关结束。

　　
第11关

　　本关开始可以选关了，地图一共5快，先到下面最左边这块地图，任务是保护一个老头，从他家出来后大批敌人到来，不过还好我方也有人支援，快到火车站的时候会出现一个特工，不过现在特工对我们来说是小菜一碟，尽情虐待他吧。把老头动上火车后本关结束

　　
第12关

　　来到下面右边的地图，本关和上一关一样是保护任务，不过这次保护的是个女人，没什么好说的把路上的人杀完，到达目的地过关。

第13关

　　同样是保护，不过这关有点难度因为被保护的人经常暴露在外面所以血下的很快，大家一定要速战速决

第14关

　　本关与其说是保护到不如说是共同作战，把门口杂兵清完后发生剧情，看到一个特工被打非出来，进去一看原来是个中国人干的(中国工夫果然最高- -! )，进去后要和他打一场，不过很好赢，打完之后是剧情，然后配合他把杂兵和特工搞定过关。

　　
第15关

　　保护任务中最难的一关，一开始要追警察，快到顶楼的时候出现30秒倒计时，要在30秒没冲到顶楼，到了顶楼后有是和一个特工大战300回合，打赢后过关

　　
第16关

　　为了节约版面，4关救人任务我就连在一起写了，首先是就一个老头(左下角地图)，老头正被敌人包围，他要你想办法把敌人增援的门堵主，一开始先把周围敌人清完，不然老头很快就挂，然后跳到敌人近来的那道门的上面会看到一个支架，把支架打坏就能堵住门了，接着上电梯到跳车控制台控制吊车把老头送有右边的台子上，敌人又会出现增援，这是还有一个拿火箭炮的敌人，坚持一会后发生剧情，然后回去控制吊车把那个拿火箭炮敌人的房间压垮。把敌人消灭后过关，接着来到右下角的地图救老摩和催尼缔，中途只要快速清人，最后特工会驾驶飞机来攻击，马上拿起地上的火箭炮把飞机打下来过关。

　　来到地图右上角，把路上的杂兵消灭一直走看到要救的黑人，帮助他清光敌人后向里走，再清一堆敌人之后，3个特工登场，特工不厉害，好好招待他们吧，

　　最后来到左上角的地图救奈奥比，一开始只有几个杂兵，很容易对付，之后3个特工登场，虐待完毕后他们会在出现一次，把这里的敌人和特工全部KO后过关，注意敌人会有多次增援

　　
第17关

　　大战塞拉夫，比较有意思的一关，先在房间里打，打死他一次之后开始中国武术传统"梅花桩"大战，注意这里只能把他打下去才会减血，接着来到电影院再次将他打败后发生剧情过关，电影院里打的这段比较有意思。

第18关

　　最经典之战 NEO大战史密斯×N ，没什么好说的尽情发挥吧，坚持一定时间就过关

第19关

　　先进入第一道门，相当变态的一关，我先代表广大玩家B4制作者，本关简直就是杀时间，在4个空间中找正确的门，第1个空间正确的门在中间靠左边的位置，第2个空间的门在一出来地方的后面，第3个空间的门要等那个女人帮你打开，第4个空间的门在一个高台上，注意从第2个空间开始会有红色的蚂蚁来骚扰你，只有用火能打死他们，但是貌似是无限增援，所以大家还是跑吧，给大家一个小技巧，按方向键上打开找门会比较简单。

　　第2道门，没什么难点就是敌人比较厉害，多使用武器就能通过，最后要打一个BOSS，这个BOSS会瞬间移动，不过不是很强

　　第3道门，进去就是BOSS战，BOSS到是不强，关键是有个女人要保护，不能让那个女的挂了，打一会，那个女人会来帮你的忙，干掉BOSS后过关

　　
第20关

　　保护拿钥匙的人，一路上都是史密斯的复制人，照顾好MR KEY，走到终点，进入下半部分，在一个教堂里，大批复制人前来攻击，要支撑到MR KEY叫你才能离开，离开后来到一个会议大厅，和干才一样跋扈他到离开为止，离开后本关结束。

　　
第21关

　　接着就是电影里的最终战，NEO和史密斯单挑，他不厉害，很轻松就能搞定，之后他会变身成"变形金刚"- -! 不要看他是最终BOSS，其实就是一垃圾，一直向左飞，看到屏幕上有按X键的提示就按下X，反复几次他就挂了，然后就是结局。